环介导恒温扩增快速检测芯片在VAP中的应用价值

doi:10.3877/cma.j.issn.2096-1537.2022.02.008

目的

探讨环介导恒温扩增（LAMP）快速检测芯片在呼吸机相关性肺炎（VAP）中的应用价值。

方法

选择2019年10月至2021年6月在四川大学华西医院ICU诊断为VAP的患者155例，年龄（56.1±8.5）岁，男性患者100例（64.5%），急性生理学与慢性健康状况（APACHE Ⅱ）评分为20（15，25）分。根据是否进行LAMP检测分为LAMP组（80例）和传统培养组（75例）。比较2组病原菌检出情况、72 h内抗菌药物调整情况和临床结局。

结果

相较于传统培养组，LAMP组病原体检出时间明显缩短，差异有统计学意义［26（21，28）h vs 48（45，69）h，Z=8.075，P＜0.001］；经验性抗菌药物首次调整时间明显缩短，差异有统计学意义［32（26，47）h vs 48（41，50）h，Z=6.584，P=0.004］；72 h内经验性抗菌药物调整比例明显升高，差异有统计学意义（42.5% vs 20.0%，χ²=20.675，P=0.003）。2组患者培养检出阳性率、72 h内抗菌药物使用恰当率、ICU住院时间及病死率比较，差异均无统计学意义（P＞0.05）。

结论

LAMP检测方法相较于传统培养检出更快速，可直接影响抗菌药物选择，致使更多的患者在更早期调整经验性抗菌药物，可作为临床病原体检验方法的有效补充。

关键词: 环介导恒温扩增, 快速检测芯片, 呼吸机相关性肺炎

Objective

To investigate the clinical value of a rapid 13-pathogen detecting loop-mediated isothermal amplification (LAMP) chip in ventilator-associated pneumonia patients.

Methods

A retrospective cohort study was conducted in intensive care unit (ICU), West China Hospital, Sichuan University from October 2019 to June 2021. 155 patients diagnosed with ventilator-associated pneumonia, with age (56.1±8.5) years, 100 male patients (64.5%), acute physiology and chronic health status (APACHE Ⅱ) score 20 (15,25). They were grouped into LAMP or conventional group based on the usage of LAMP technique (80 in LAMP group and 75 in conventional group). Pathogens identification, antimicrobial therapy in 72 h and clinical outcome between these two groups were compared.

Results

Compared with the conventional group, the pathogen detection time of the LAMP group was significantly shorter, and the difference was statistically significant [26 (21, 28) h vs 48 (45, 69) h, Z=8.075, P＜0.001]; the adjustment time of the first empirical antimicrobial drugs was significantly shorter, and the difference was significant [32 (26, 47) h vs 48 (41, 50) h, Z=6.584, P=0.004]; the proportion of empirical antimicrobial adjustments was higher significantly within 72 h with statistic significance (42.5% vs 20.0%, χ²=20.675, P=0.003). There were no significant differences in positive detected rate of in the culture, the appropriate antimicrobial use in 72 h, ICU stay and mortality rate (P＞0.05).

Conclusion

Compared with conventional culture, LAMP test method can identify pathogens faster, and directly guide the adjustment of antibiotics. It can be used as an effective supplement to clinical test methods to guide clinical medication.

Key words: Loop-mediated isothermal amplification, Rapid diagnostic chip, Ventilator-associated pneumonia

表1 2组VAP患者基线资料比较

基线资料	合计（155例）	LAMP组（80例）	传统培养组（75例）	统计值	P值
一般资料
年龄［岁， $x ¯$ ±s］	56.1±8.5	57.2±9.2	55.6±8.2	t=0.665	0.838
男性［例（%）］	100（64.5）	49（61.3）	51（68.0）	χ²=0.244	0.380
基础疾病［例（%）］
高血压	71（45.8）	38（47.5）	33（44.0）	χ²=1.055	0.662
糖尿病	27（17.4）	15（18.8）	12（16.0）	χ²=0.982	0.652
心血管疾病	22（14.2）	9（11.3）	13（17.3）	χ²=2.746	0.278
慢性肺部疾病	48（31.0）	24（30.0）	24（32.0）	χ²=0.689	0.788
慢性肾脏疾病	22（14.2）	14（17.5）	8（10.7）	χ²=3.052	0.223
慢性肝脏疾病	9（5.9）	6（7.5）	3（4.0）	χ²=2.047	0.352
恶性肿瘤	24（15.5）	13（16.3）	11（14.7）	χ²=0.766	0.785
免疫抑制	23（14.9）	12（15.0）	11（14.7）	χ²=0.186	0.953
实验室检查
体温（℃， $x ¯$ ±s）	37.4±0.6	37.4±0.6	37.2±0.7	t=0.894	0.706
白细胞（10⁹/L， $x ¯$ ±s）	10.8±1.7	10.9±1.9	10.8±1.7	t=0.796	0.765
降钙素原［ng/ml，M（Q₂₅，Q₇₅）］	10.7（0.4，30.7）	11.3（0.4，31.3）	10.0（0.3，28.8）	Z=2.056	0.355
乳酸［mmol/L，M（Q₂₅，Q₇₅）］	1.5（1.1，1.9）	1.5（1.1，1.9）	1.45（1.1，1.9）	Z=0.346	0.994
严重度评分
APACHE Ⅱ评分［分，M（Q₂₅，Q₇₅）］	20（15，25）	21（15，26）	18（14，24）	Z=0.974	0.381
ICU支持治疗［例（%）］
肾替代治疗	27（17.4）	12（15.0）	15（20.0）	χ²=1.752	0.412
血管活性药物	51（32.9）	27（33.8）	24（32.0）	χ²=0.846	0.817

表1 2组VAP患者基线资料比较

基线资料	合计（155例）	LAMP组（80例）	传统培养组（75例）	统计值	P值
一般资料
年龄［岁， $x ¯$ ±s］	56.1±8.5	57.2±9.2	55.6±8.2	t=0.665	0.838
男性［例（%）］	100（64.5）	49（61.3）	51（68.0）	χ²=0.244	0.380
基础疾病［例（%）］
高血压	71（45.8）	38（47.5）	33（44.0）	χ²=1.055	0.662
糖尿病	27（17.4）	15（18.8）	12（16.0）	χ²=0.982	0.652
心血管疾病	22（14.2）	9（11.3）	13（17.3）	χ²=2.746	0.278
慢性肺部疾病	48（31.0）	24（30.0）	24（32.0）	χ²=0.689	0.788
慢性肾脏疾病	22（14.2）	14（17.5）	8（10.7）	χ²=3.052	0.223
慢性肝脏疾病	9（5.9）	6（7.5）	3（4.0）	χ²=2.047	0.352
恶性肿瘤	24（15.5）	13（16.3）	11（14.7）	χ²=0.766	0.785
免疫抑制	23（14.9）	12（15.0）	11（14.7）	χ²=0.186	0.953
实验室检查
体温（℃， $x ¯$ ±s）	37.4±0.6	37.4±0.6	37.2±0.7	t=0.894	0.706
白细胞（10⁹/L， $x ¯$ ±s）	10.8±1.7	10.9±1.9	10.8±1.7	t=0.796	0.765
降钙素原［ng/ml，M（Q₂₅，Q₇₅）］	10.7（0.4，30.7）	11.3（0.4，31.3）	10.0（0.3，28.8）	Z=2.056	0.355
乳酸［mmol/L，M（Q₂₅，Q₇₅）］	1.5（1.1，1.9）	1.5（1.1，1.9）	1.45（1.1，1.9）	Z=0.346	0.994
严重度评分
APACHE Ⅱ评分［分，M（Q₂₅，Q₇₅）］	20（15，25）	21（15，26）	18（14，24）	Z=0.974	0.381
ICU支持治疗［例（%）］
肾替代治疗	27（17.4）	12（15.0）	15（20.0）	χ²=1.752	0.412
血管活性药物	51（32.9）	27（33.8）	24（32.0）	χ²=0.846	0.817

表2 2组VAP患者病原菌检验结果［例（%）］

病原菌检验	LAMP组（80例）		传统培养组（75例）
病原菌检验	LAMP结果	培养结果	培养结果
革兰氏阴性菌
鲍曼不动杆菌	28（35.0）	22（27.5）	18（24.0）
肺炎克雷伯菌	13（16.3）	6（7.5）	8（10.7）
铜绿假单胞菌	6（7.5）	2（2.5）	3（4.0）
大肠埃希菌	5（6.3）	2（2.5）	1（1.3）
嗜麦芽窄食单胞菌	5（6.3）	5（6.3）	9（12.0）
流感嗜血杆菌	1（1.3）	0	0
革兰氏阳性菌
肺炎链球菌	1（1.3）	0	0
金黄色葡萄球菌	2（2.5）	1（1.3）	0
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌	2（2.5）	0	0
其他病原体
结核分枝杆菌	1（1.3）	0	0
嗜肺军团菌	1（1.3）	0	0
肺炎支原体	0	0	0
肺炎衣原体	0	0	0
不包括于LAMP检验范围菌种
纹带棒杆菌	-	2（2.5）	2（2.7）
嗜水气单胞菌	-	1（1.3）	0
黏质沙雷菌	-	0	1（1.3）
阴沟肠杆菌	-	1（1.3）	1（1.3）
多种病原菌检出	13（16.3）	5（6.3）	5（6.7）
检出阳性	46（57.5）	41（51.3）	37（49.3）

表2 2组VAP患者病原菌检验结果［例（%）］

病原菌检验	LAMP组（80例）		传统培养组（75例）
病原菌检验	LAMP结果	培养结果	培养结果
革兰氏阴性菌
鲍曼不动杆菌	28（35.0）	22（27.5）	18（24.0）
肺炎克雷伯菌	13（16.3）	6（7.5）	8（10.7）
铜绿假单胞菌	6（7.5）	2（2.5）	3（4.0）
大肠埃希菌	5（6.3）	2（2.5）	1（1.3）
嗜麦芽窄食单胞菌	5（6.3）	5（6.3）	9（12.0）
流感嗜血杆菌	1（1.3）	0	0
革兰氏阳性菌
肺炎链球菌	1（1.3）	0	0
金黄色葡萄球菌	2（2.5）	1（1.3）	0
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌	2（2.5）	0	0
其他病原体
结核分枝杆菌	1（1.3）	0	0
嗜肺军团菌	1（1.3）	0	0
肺炎支原体	0	0	0
肺炎衣原体	0	0	0
不包括于LAMP检验范围菌种
纹带棒杆菌	-	2（2.5）	2（2.7）
嗜水气单胞菌	-	1（1.3）	0
黏质沙雷菌	-	0	1（1.3）
阴沟肠杆菌	-	1（1.3）	1（1.3）
多种病原菌检出	13（16.3）	5（6.3）	5（6.7）
检出阳性	46（57.5）	41（51.3）	37（49.3）

表3 2组VAP患者对早期抗菌药物调整及临床结局的影响

药物调整及临床结局指标	LAMP组（80例）	传统培养组（75例）	统计值	P值
检出时间［h，M（Q₂₅，Q₇₅）］	26（21，28）	48（45，69）	Z=8.075	＜0.001
经验性抗菌药物首次调整时间［h，M（Q₂₅，Q₇₅）］	32（26，47）	48（41，50）	Z=6.584	0.004
72 h经验性抗菌药物调整［例（%）］	34（42.5）	15（20.0）	χ²=20.675	0.003
升阶梯	24	10
降阶梯	8	3
不能确定	2	2
培养检出阳性［例（%）］	41（51.3）	37（49.3）	χ²=0.316	0.811
抗菌药物使用恰当［例（%）］
36 h	29（70.7）	20（54.1）	χ²=4.253	0.098
48 h	31（75.6）	23（62.2）	χ²=2.985	0.150
72 h	33（80.5）	29（78.4）	χ²=0.897	0.652
ICU住院时间［d，M（Q₂₅，Q₇₅）］	18（10，27）	17（10，28）	Z=0.696	0.335
ICU病死［例（%）］	27（33.8）	28（37.3）	χ²=0.764	0.641

表3 2组VAP患者对早期抗菌药物调整及临床结局的影响

药物调整及临床结局指标	LAMP组（80例）	传统培养组（75例）	统计值	P值
检出时间［h，M（Q₂₅，Q₇₅）］	26（21，28）	48（45，69）	Z=8.075	＜0.001
经验性抗菌药物首次调整时间［h，M（Q₂₅，Q₇₅）］	32（26，47）	48（41，50）	Z=6.584	0.004
72 h经验性抗菌药物调整［例（%）］	34（42.5）	15（20.0）	χ²=20.675	0.003
升阶梯	24	10
降阶梯	8	3
不能确定	2	2
培养检出阳性［例（%）］	41（51.3）	37（49.3）	χ²=0.316	0.811
抗菌药物使用恰当［例（%）］
36 h	29（70.7）	20（54.1）	χ²=4.253	0.098
48 h	31（75.6）	23（62.2）	χ²=2.985	0.150
72 h	33（80.5）	29（78.4）	χ²=0.897	0.652
ICU住院时间［d，M（Q₂₅，Q₇₅）］	18（10，27）	17（10，28）	Z=0.696	0.335
ICU病死［例（%）］	27（33.8）	28（37.3）	χ²=0.764	0.641

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Clinical evaluation of a rapid 13-pathogen detecting loop-mediated isothermal amplification chip in ventilator-associated pneumonia patients

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